不孕不育症中约10-20%由免疫因素引起。不论精子、卵子、受精卵、性激素、促性腺激素以至精浆，都具有一定的抗原性而导致免疫反应，造成不孕。免疫性不孕分为同种免疫、局部免疫和自身免疫3类。

同种免疫指男方的精子、精浆作为抗原，在女方体内产生抗体，使精子凝集或使精子失去活动力。在一般情况下，女性并不产生免疫反应，只有约15-18%的不孕妇女体内有抗精子抗体存在。在女性经期或有子宫内膜炎等疾患时，子宫内膜有损伤或者肛门性交，精子及其抗原物质才易于进入血流而激发女性的免疫反应。

局部免疫是指有些不孕妇女的子宫颈粘膜及子宫内膜含有产生免疫球蛋白g和a的淋巴样细胞，子宫颈粘液内含有抗精子的免疫球蛋白g、a、m。故子宫颈及女性生殖道对精子具有局部免疫作用。

自身免疫是男性精子、精浆或女性卵子、生殖道分泌物、激素等溢出生殖道进入自身的周围组织，造成自己身体的免疫反应，在体内产生相应的抗体物质，影响精子的活力或卵泡成熟和排卵。有人研究证实，5-9%的不育男性体内有抗精子抗体存在，其产生的原因可能是由于双侧输精管阻塞或结扎，或过去患有严重的生殖道感染所致。细胞免疫因素也与男性不育症有关，一些不育者精液中白细胞增高，可能其产生的淋巴因子和巨噬细胞因子等可以影响精子运动，使精子活力下降，精子形态改变。女性体内抗性腺激素抗体和抗性腺激素受体的抗体可造成卵巢早衰、卵巢性闭经。子宫内膜异位症于月经周期中可产生分解物，由巨噬细胞系统消除，刺激抗体产生而造成自身免疫。

就治疗方法而言，通常西医采取的为隔绝疗法，即让患者性交时使用避孕套，用以避免精子抗原对女方的进一步刺激，减少女方抗精子抗体的重新产生，持续一定时间后（通常主张持续使用半年-1年）抗体滴度会逐渐下降并消失。然后在女方排卵期不用避孕套，便可望得到受孕的机会，但此法并不能改善妊娠率，只可作为辅助治疗，另外西医上还可运用免疫抑制疗法：用肾上腺皮质激素类药物；强的松，地塞米松等，采取低剂量持续疗法或高剂量间歇疗法，成功率仅为 20-40%，且副作用大，患者不易接受。