免疫因素可以导致女性不孕的主要原因是由于同种抗体即抗精子抗体到原因所导致的。正常情况下精子和胚胎对母体来说都是异物。因此每次性生活都可能是一次免疫接种，但只有少数妇女产生抗精子抗体。正常性生活情况下，机体对生殖过程中任一环节产生自发性免疫，延迟受孕二年以上称为免疫性不孕症。免疫性不孕症有广义与狭义之分。

女方宫颈粘液或血清中有抗精子抗体，可导致精子不能顺利通过宫颈，甚至凝集、死亡。男方精浆或血清中含有自身免疫性抗体，导致精子凝集、死亡。

女方含有自身抗卵巢、抗卵透明带和抗子宫内膜抗体，干扰卵子的成熟和精、卵的结合及着床。

夫妇（或母儿）之间血型不合等因素，可造成习惯性流产、死胎、死产或新生儿死亡。夫妇双方免疫因素不孕原因约占15～20%。

此外，过度肥胖或营养不良及维生素缺乏（如维生素C、E和叶酸）都会影响妊娠或造成孕卵发育障碍而流产。糖尿病、感染或慢性消耗性疾病如肝炎、结核都会影响妊娠。一些微量元素如血清中铜、锌含量低也可影响妇女受孕。

最简单的方法是使用避孕套，停止与抗原接触使体内抗体逐渐下降（大约半年），从而减少抗体反应。对于有自身免疫抗体者可采用中药治疗，消除抗体。也可采用人工授精的方法。